一、了解基本概念：

在回答这个问题之前，我们先来了解一下“软件”和“定制开发”的定义。根据国家税务总局的相关规定，“软件”特指计算机程序及其有关文档；而“定制开发”，则是指为满足特定需求而进行的软件设计与实现过程。

二、税率比较分析：

    • 6%：适用于一般纳税人提供的信息技术服务，如软件研发和技术转让等。
    • 13%：则针对的是销售或提供其他应税劳务和货物的情况。

三、适用税率详解：

对于“软件定制开发”这种情形来说，通常会按6%的增值税率计缴。这是因为国家税务总局明确规定了信息技术服务属于一般纳税人适用范围内的项目之一，其税率为6%。

然而，在实际操作中，某些特殊情况可能会导致企业需要按照13%来缴纳增值税。例如：如果软件定制开发过程中涉及到硬件设备或销售成品软件，则可能被视为“货物”而非“劳务”，从而按13%税率征收。

四、案例说明：

假设某公司为一家制造企业设计了一套针对生产设备管理的软件系统，该系统不仅包括软件本身，还提供了一些生产设备配件。在这种情况下，该公司在销售这套综合解决方案时应当按照13%的税率缴纳增值税。

但若仅仅为客户定制开发一套生产管理系统，并未涉及任何硬件或设备，则通常可以按照6%的税率计税。

五、总结：

软件定制开发项目的具体税率取决于项目本身的内容及其分类。一般来说，主要针对软件服务部分的企业会适用6%的标准税率；而若包含有销售硬件等其他因素时，则可能会使用13%的较高税率。

因此，在确定具体税率为之前，请务必仔细审查合同内容并咨询专业税务顾问以确保准确无误地完成申报工作。