一、了解基本概念
首先，我们需要明确一点：软件定制开发的增值税率并不是固定的6%或13%，而取决于具体业务类型和国家政策。接下来我们详细分析这两种情况下的优劣。
二、税率6%
优点：对于小型企业而言，采用6%的增值税率意味着较低的成本负担，有助于提高企业的竞争力。
缺点：虽然成本相对较低，但税率过低也可能导致企业在某些方面的投入不足，影响软件开发的质量和功能完善度。
三、税率13%
优点：采用13%的增值税率表明企业更注重产品质量和服务水平。高税率意味着企业在项目管理和技术投入方面更加谨慎。
缺点：较高的成本可能会增加企业的运营压力，尤其是在初期阶段。但长期来看，高质量的服务和产品可以吸引更多客户。
四、选择建议
综上所述，选择6%还是13%的增值税率取决于企业自身的情况及目标市场。如果希望降低成本并快速进入市场，可以选择较低税率；反之，则应考虑长期发展策略，采用较高的税率以保证服务质量。
注：本文提供的信息仅供参考，具体操作还需遵循当地税务机关的规定。